Anche questo lago è noto da tempo, come dimostra un documento storico del 1182 (Palmisano & Fanizzi, 1992). D’altra parte, nei dintorni del lago vi sono importanti testimonianze archeologiche, con un antico insediamento dell’età dei Metalli, di cui si conservano ancora i resti dell’antica cinta muraria (L’Abbate, 1981). Vi è stato inoltre rinvenuto abbondante materiale ceramico, relativo ad un villaggio capannicolo dell’età del Bronzo finale, i cui rinvenimenti sono descritti da L’Abbate, 1982.
Il lago Agnano occupa la parte centrale di una valle carsica orientata NNW-SSE, che si sviluppa a partire all’incirca dalla SP/102 (TuriConversano). La valle ha una lunghezza di poco superiore al chilometro, e presenta una larghezza media di 100-150 metri. Il massimo di rilievo è di circa 25 metri in corrispondenza del sito dell’insediamento preistorico di Agnano.